Een dag voor de EK in München kreeg de Zwitser te horen dat hij voorlopig geschorst is en terug naar huis moet. De Zwitserse wielerbond werd donderdag, een dag voor de EK-wedstrijd, ingelicht over de positieve dopingtest. In Tokio gold Flückiger als een van de concurrenten voor Mathieu van der Poel, die voor goud wilde gaan op de mountainbike. Door rugproblemen meldde hij zich een maand later af voor de WK.